API là duy nhất do nhiều đặc điểm. Ví dụ, API trao đổi dữ liệu giữa các hệ thống, trong khi các ứng dụng web được người dùng cuối truy cập thông qua trình duyệt web. API cũng sử dụng một định dạng khác để vận chuyển dữ liệu và truy cập trực tiếp vào các hệ thống phụ trợ – thường đóng vai trò là trung gian giữa các ứng dụng web hiện đại và cơ sở dữ liệu và máy chủ phụ trợ của chúng. Do những khác biệt này và những khác biệt khác, phương pháp phát hiện bảo mật API khác với bảo mật ứng dụng web, ngay cả trong các danh mục lỗ hổng chồng chéo như tấn công tiêm nhiễm và rủi ro truy cập.

Các số liệu khác nhau có thể giúp các bên liên quan về CNTT, bảo mật và phát triển ứng dụng đánh giá mức độ bảo mật API của họ. Ví dụ: một tổ chức có mô hình bảo mật API mạnh mẽ phải có kho tài sản API hiện tại cho thấy tất cả các API đều tuân thủ dữ liệu và sử dụng các phương pháp xác thực hoặc ủy quyền mạnh. Kiểm toán cũng nên được thực hiện để xác định thông tin xác thực bị lộ/rò rỉ được sử dụng trong các yêu cầu API và để quét thông tin nhận dạng (PII), dữ liệu thẻ tín dụng hoặc thông tin chăm sóc sức khỏe cá nhân trong các yêu cầu/phản hồi API. Khả năng đặt giới hạn tỷ lệ thông minh, thích ứng trên các API, được xác định bởi các mẫu lưu lượng có thể quan sát được cho từng điểm cuối— cũng báo hiệu bảo mật API tiên tiến hơn.